目前，抗乙肝病毒的药物有两大类，干扰素和核苷类似物，HBV的复制的标志是肝细胞核内的cccDNA，核苷类似物仅仅能抑制HBV的复制，但对cccDNA的清除作用甚微，有研究发现在在感染肝细胞不减少的情况下阿德福韦酯每年可使cccDNA下降0.8log，恩替卡韦和拉米夫定也在48周才能使cccDNA下降1.0log，因此应用核苷类似物需要许多年才能使cccDNA清除，但是很多病人尚未等到cccDNA清除就出现了病毒变异。

干扰素可以通过细胞溶解和非细胞溶解的免疫清除模式清除细胞内的cccDNA，有限的疗程和获得血清转换后复发率低，但疗效仍相对较低，研究显示Peg interferon 可以是HBeAg阳性的慢性乙型肝炎HbeAg/抗HBe血清转换率达30％-40％，而且副作用较多。

因此抗病毒治疗药物的联合治疗越来越受到临床专家得关注，但是循证医学的证据尚待进一步发现。首先核苷类似物之间的联合相对较常见，已被证实可以降低HBV的耐药率，但只有一些低基因耐药障碍性药物联合治疗的证据（拉米夫定，阿德福韦）。联合疗法可能实现更大程度的抑制HBV复制，但这并没有得到较高的血清转换率（乙肝e抗原或乙肝表面抗原）。应用高基因变异屏障的药物（替诺福韦，恩替卡韦）需进一步探讨。核苷类似物之间的联合治疗适用于一下特定病人群体：肝硬化失代偿期的人，那些与人类免疫缺陷病毒和乙肝病毒的抗逆转录病毒疗法是谁对合并感染，那些谁经历了肝移植，并与耐药HBV感染者。

对于干扰素联合核苷类似物治疗方法更应该引起足够的重视，Peg interferon联合拉米夫定48周后可使HBV DNA清除更彻底，获得更高的感染HBV的肝细胞清除率，HBVDNA阴转率和HbeAg/抗HBe 转换率较单用药高，但是治疗停止后24周这种HBV指标的的阴转不能维持，单用药和联合应用患者的HBVDNA阴转率和HbeAg/抗HBe 转换率差异无显著性，但有专家认为此课题的设计存在缺陷，疗程过短，尤其是应用拉米夫定1年不应停药。另一项研究Peg interferon联合阿德福韦酯治疗HBeAg阳性的慢性乙型肝炎144周（Peg interferonα2a治疗48周和阿德福韦酯治疗144周）结果显示联合治疗组肝细胞cccDNA下降2.4log，Hbeg和HBsAg血清转换率分别为53.3％和16.6％。目前关于恩替卡韦联合其他抗病毒药物的联合方案尚未看到循证医学的报道，作为具有高耐药基因屏障和高疗效的核苷类似物联合治疗有可能获得更高的抗病毒应答率。

总之，在抗HBV药物尚未获得新的突破之前，目前的抗病毒药物的联合治疗是一个趋势，但是如何联合才能获得更高的应答率，才能有更以利于获得慢乙肝治疗的目标是值得更深一步探讨的课题。